הקצה העליון של חוט השדרה שנמצא בתוך הגולגולת, ויוצר את החלק התחתון של גזע המוח. המוח המוארך יוצר את הנתיב העיקרי לכניסה ויציאה של אותות עצביים אל הגולגולת וממנה. בנוסף, הוא מכיל את המרכזים האחראים לוויסות לחץ הדם, הנשימה, הפרשת רוק ובליעה. עצבי הגולגולת VI-XII יוצאים מן המוח באזור זה.